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科研高性能计算解决方案

高性能计算(High Performance Computing,简称HPC)是计算机科学的一个分支,研究并行算法和开发相关软件,致力于开发高性能计算机(High Performance Computer),满足科学计算、工程计算、海量数据处理等需要。

高校、研究所等教育和研究机构是高性能计算的主要用户。这些科研机构的高性能计算应用以科学计算为主,特别是物理、化学、材料、生物等学科对高性能计算的需求巨大。不同学科的计算类型和特征不同,对高性能计算系统的需求也不相同。曙光科研领域高性能计算方案基于“混合架构”设计,通过灵活、动态调整可以满足各学科计算需求。

 

方案的计算子系统以高密度、低功耗、易管理的刀片服务器为主,如曙光TC3600/TC4600,刀片节点配置以双路为主,采用最新的64位Intel或AMD处理器,注重浮点峰值和内存性能;刀片计算节点可以满足绝大部分应用需求;针对部分特殊应用,可以配置一些单机性能高、大内存、高I/O的SMP多路胖节点;此外,也可以根据应用类型,配置GPU、MIC等协处理器节点;计算网络采用低延迟、高带宽的InfiniBand,能大幅度提高应用程序的计算速度和并行加速比;针对大规模高性能计算集群系统,全局共享存储的性能和扩展性非常关键,目前主流的解决方案是采用分布式的并行存储系统,如曙光ParaStor。此外,关键应用可以使用曙光Clusnap集群容错模块进行系统级断点保护。在软件层面,曙光为科研用户配备完备的并行软件开发和运行环境;配置曙光Gridview集群监控管理及作业调度软件,包含针对不同应用软件开发的Web作业提交界面ClusPortal,可以大大降低高性能计算机的使用门槛。

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