购买与服务热线:400-810-0466

服务邮箱:Support@sugon.com


农业基因组学是当代农业科技创新的核心引擎,也是带动我国农业高速发展的“复兴号列车”。

近日,曙光携手中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所(以下简称“基因组所”),助力搭建基因数大数据计算平台存储项目。其中,利用生物组学大数据推动生物育种变革,打造了贯穿“种质资源收集-基因组测序与分析-功能基因挖掘-分子设计育种-品种推广”全产业的创新链条。

1.jpg

用信息技术打通产业创新链条

基因组所是国内唯一一家专门从事农业基因组学研究的国家级研究所,主要从事农业基因组学、农业动植物分子育种等领域的科学研究,致力于推动生命科学前沿学科与农业、食品与健康、生态与环境等三大领域的交叉融合,加速生命前沿技术在农业和社会经济发展中的应用。

如今,生物信息学正扮演着越来越重要的角色,在信息时代给基因组学巨大的推动力。基因组学领域产生了海量数据,如何通过农业生物信息学与计算科学挖掘出更大价值,成为基因组所业务发展的关键环节。

该大数据计算平台计算能力400Tflops, 存储能力10PB,计算分区和存储分区网络采用100Gb/s Infiniband EDR高速互联,高速互联网络的搭建为存储提供高达80Gb/s的聚合带宽,为实现生物大数据的深度挖掘奠定基础。其中存储资源分区采用曙光ParaStor分布式存储系统,可以为基因数据库等提供海量存储空间。

通过高效、安全的基因数据库,可有效利用基因组学、蛋白组学、代谢组学等技术手段,实现高品质精准功能育种;重点突破人类基因组学、营养代谢组学等生物组学技术难题,创制营养靶向设计、健康个性订制的新型营养健康食品。

为“生物信息”提供高可靠平台

随着多组学数据额激增,数据挖掘的难度不断加大。作为底层的存储系统,既要满足海量基因数据激增带来的扩展性需求,又要满足带宽及IOPS需求。

中科曙光凭借多年在生物基因领域积累的经验,打造了完善的生物基因行业云存储解决方案。通过Scale-Out横向扩展、IB+RDMA高速互联、内核态POSIX协议、智能SSD Cache及小文件聚合等技术,消除传统的Scale-up纵向扩展存储架构的性能局限性,解决生物基因应用中对海量大文件存储场景高聚合带宽、小文件存储场景高IOPS的存储需求。

其次,基因研究产生的数据正以每12-18个月10倍的速度快速增长,曙光ParaStor分布式存储系统可通过性能与容量的线性增长,满足存储系统对数据处理能力和扩展性的要求,并通过多种技术手段,从物理底层到逻辑层全方位保证存储系统高可靠性和高可用性,满足前端多种基因测序软件、多种业务应用的存储对接需求。

基因组、蛋白组、代谢组等生物组学、基因编辑、合成生物学等一系列学科发展和技术创新,推动着农业生物技术以前所未有的速度向前发展。曙光不断将最先进的信息技术与生物信息学进行融合。将自身的存储产品与第二代基因测序和三代测序、主流应用软件长期对接测试与优化是曙光扎根于该领域的基础。对于生物信息复杂应用软件的完美适配以及均衡稳定的性能表现,让曙光在生物基因领域得到了广泛的认可。


上一篇:更快更燃,曙光存储支撑世界杯的超清体验!

下一篇:发力工业互联网,中科曙光助推玉溪数字化转型!

联系我们