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“科研发现不应停留在实验室,而是要转化为临床可用的新检查或治疗手段”,这是21 世纪初提出的最早关于“转化医学”的概念。

不破不立,转换医学打破了临床与实验室之间的“屏障”,是将基础医学研究和临床治疗连接起来的一种新的思维方式。在中国,转化医学已成为国家在生物医学领域里一个重大焦点。

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助力瑞金医院推进“转化医学”研究

近期,中科曙光助力上海交通大学医学院附属瑞金医院(以下简称“瑞金医院”)搭建“临床资源深度分析和挖掘测序模块计算平台”,通过提升医疗数据检索、统计分析、图形化呈现在内的大规模数据挖掘能力,推进“转化医学”领域研究。

由瑞金医院承担建设的国家转化医学中心 (上海),通过聚焦危害中国人群健康的疾病,包括白血病在内的血液系统恶性肿瘤及胃肠肿瘤、糖尿病等代谢性疾病,以及冠心病、高血压等心脑血管疾病等,让写在纸上的论文尽快变成用于临床的新治疗方法,联手共克重大疾病。

覆盖全生命周期的技术服务

曙光为瑞金医院提供计算存储网络、管理网络、GridView集群管理调度系统,并为用户提供应用开发环境以及在线运维系统等覆盖全生命周期的技术服务。

系统主要应用于基因测序相关的应用,而基因测序软件软件如 SOAP2,BWA,BWASW、VCAKE、QSRA 等在计算时会产生中间数据,存储性能的好坏直接影响整个计算过程所需要的时间,因此对存储的性能要求非常苛刻。

曙光ParaStor分布式存储系统可通过性能与容量的线性增长,满足存储系统对数据处理能力和扩展性的要求,并通过多种技术手段,从物理底层到逻辑层全方位保证存储系统高可靠性和高可用性,满足前端多种基因测序软件、多种业务应用的存储对接需求。

此外,为了协助系统高效交付用户并快速上线,以及保障上线后的售后服务,通过曙光 EasyOP 在线运维平台,用户可随时联络曙光拥有深入行业应用经验的相关各领域专家随时对集群进行线上优化,并可通过 EasyOP 在线运维平台预约上门调优服务。

基因研究产生的数据正以每12-18个月10倍的速度快速增长,生命科学领域对计算的需求及要求将更广阔和严苛。未来,曙光将携手更多生命科学领域客户,为其业务提供有效的性能保障和技术支持。


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